युगनीएक जटिल जीनोम विश्लेषण सूट | |
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युगनी विवरण
Ugene एक व्यापक जीनोम विश्लेषण सूट है जिसमें कई अनुक्रम संरेखण और एक जटिल हम्म बिल्डर और खोज मॉड्यूल है। Ugene एक आसान उपकरण है जो एक दृश्य और इंटरैक्टिव जीनोम ब्राउज़िंग अनुभव भी प्रदान करता है। इसके अलावा उपलब्ध: पोर्टेबल Ugene मुख्य विशेषताएं: मांसपेशी 3 और मांसपेशी 4 का उपयोग कर एकाधिक अनुक्रम संरेखण; हम्म प्रोफाइल एचएमएमईआर 2 और एचएमएमईआर 3 के स्रोत के आधार पर निर्माण और खोज; प्राइमर 3 का उपयोग कर पीसीआर प्राइमर्स डिजाइन; गोर चतुर्थ और psipred का उपयोग कर प्रोटीन माध्यमिक संरचना भविष्यवाणी; प्रतिबंध एंजाइमों और रिबेस के साथ एकीकरण की खोज; बेहद तेजी से दोहराएं खोजक; Sitecon का उपयोग कर ट्रांसक्रिप्शन कारक बाध्यकारी साइटों की खोज; ओआरएफ खोजक; पूर्ण स्मिथ-वाटरमैन एल्गोरिदम कार्यान्वयन। क्रोमैटोग्राम विज़ुअलाइजेशन; पीडीबी और एमएमडीबी प्रारूपों में फ़ाइलों के लिए 3 डी व्यूअर; एकाधिक अनुक्रम संरेखण संपादक; कस्टम कम्प्यूटेशनल वर्कफ़्लो के लिए वर्कफ़्लो डिज़ाइनर का उपयोग करना आसान है। आधुनिक मल्टीकोर प्रोसेसर और एसएसई निर्देशों का पूरा समर्थन; एनवीआईडीआईए कुडा और एटीआई स्ट्रीम का उपयोग कर आधुनिक जीपीयू के बॉक्स समर्थन से बाहर; सेल ब्रॉडबैंड इंजन के लिए एकीकृत समाधान; सुपरकंप्यूटर और वितरित कंप्यूटिंग के लिए निजी समाधान।
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