स्नूप्घा जीनोमिक हाइब्रिडाइजेशन डेटा व्यूअर।
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स्नूप्घा विवरण

स्नूप्घ एक जावा डेस्कटॉप प्रोग्राम है, जो तुलनात्मक जीनोमिक हाइब्रिडाइजेशन (सीजीएच) डेटा को विज़ुअलाइज़ करने और अन्वेषण करने में आपकी सहायता के लिए डिज़ाइन किया गया है। सॉफ्टवेयर उपयोगकर्ता को एक साथ डेटा के कई सेटों का अंतःक्रियात्मक रूप से विश्लेषण करने की अनुमति देता है। इनपुट एक टैब-, अंतरिक्ष या अल्पविराम-सीमांकित प्रारूप पर आधारित है, जिसमें एक या अधिक तुलना या नमूने के अनुरूप लॉग तीव्रता मानों की श्रृंखला शामिल है। Snoopcgh असीमित ज़ूम (दोनों अक्षों में) के साथ सीजीएच प्लॉट प्रदान करता है जिसे माउस के साथ अंतःक्रियात्मक रूप से खोजा जा सकता है। कई परतों का उपयोग, जिसे ढेर किया जा सकता है और संयुक्त किया जा सकता है, डेटा के दृश्य को सुविधाजनक बनाता है। सीजीएच अनुपात को फ़िल्टर करने या ब्याज के क्षेत्रों में सांख्यिकीय विश्लेषण करने के लिए साजिश में कई परतों को लागू करना संभव है। विश्लेषण विधियों को लागू किया गया है और तेजी से विज़ुअलाइज़ेशन और अभ्यंतर संरचनात्मक विविधता (एसवीएस) के विच्छेदन को सक्षम किया गया है। विशेष रूप से, डेटा को हायर वेवलेट के आधार पर एक एल्गोरिदम का उपयोग करके चिकना किया जाता है, और संभावित एसवी के द्वीपों को एसडब्ल्यू-सरणी का उपयोग करके अनुमानित किया जाता है। हम मजबूती बढ़ाने के अनुमान से पहले आउटलेयर को हटाते हैं, और प्रशंसनीय एसवीएस के सांख्यिकीय महत्व के सांख्यिकीय महत्व और मजबूती के स्तर का अनुमान लगाते हैं। पुटीनेटिव एसवी की यह मात्रा ब्याज के क्षेत्रों को रैंक करने की क्षमता की ओर ले जाती है। अन्य एसवी पहचान एल्गोरिदम भविष्य में एकीकृत किया जा सकता है। Snoopcgh की एक शक्तिशाली विशेषता जीनोमिक ब्राउज़र से डाउनलोड करने योग्य एनोटेशन फ़ाइलों के साथ इंटरफ़ेस करने की क्षमता है, जिसमें जीन नाम और जीनोमिक सुविधाओं पर जानकारी शामिल है। उपयोगकर्ता के पास साजिश के पैर पर एनोटेशन का एक दृश्य प्रतिनिधित्व है और उन पर क्लिक करके या पाठ्य खोज द्वारा आसानी से विस्तृत पाठ्य जानकारी तक पहुंच सकता है। मुख्य जीनोमिक ब्राउज़र के प्रत्यक्ष लिंक शामिल हैं।

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