Arlequin जनसंख्या नमूने के संग्रह की अनुवांशिक और जनसांख्यिकीय विशेषताओं पर जानकारी निकालने के लिए, बुनियादी विधियों और सांख्यिकीय परीक्षणों के एक बड़े सेट के साथ जनसंख्या जेनेटिक्स में औसत उपयोगकर्ता प्रदान करते हैं। ग्राफिकल इंटरफ़ेस को उपयोगकर्ताओं को अपने डेटा पर किए जाने वाले विभिन्न विश्लेषण का तेज़ी से चुनने की अनुमति देने के लिए डिज़ाइन किया गया है। विभिन्न चयनित विकल्पों के साथ, विभिन्न दृष्टिकोणों से समान डेटा सेट के कई बार विश्लेषण करने के लिए, डेटा का पता लगाने में सक्षम होना महत्वपूर्ण महसूस हुआ। Arlequin में लागू सांख्यिकीय परीक्षणों को चुना गया है जैसे छुपाम धारणाओं को कम करने और यथासंभव शक्तिशाली होने के लिए। इस प्रकार, वे अक्सर कुछ अपवादों के साथ क्रमपरिवर्तन परीक्षण या सटीक परीक्षणों का रूप लेते हैं। चूंकि अरेक्विन में सुविधाओं का एक समृद्ध सेट और कई विकल्प हैं, इसका मतलब है कि उपयोगकर्ता को उन्हें सीखने में कुछ समय बिताना पड़ता है।
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