jmodeltest फ़िलोजेनेटिक मॉडल औसत
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jmodeltest विवरण

Jmodeltest एक वैज्ञानिक अनुप्रयोग है जो डेटा के बड़े पैकेट के समर्थन के साथ, डीएनए विश्लेषण में उपयोगी, न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन का चयन कर सकता है। यह एक ओपन-सोर्स, क्रॉस-प्लेटफ़ॉर्म प्रोजेक्ट है जो छात्रों, शिक्षकों के साथ-साथ डीएनए क्षेत्र में शोधकर्ताओं को लक्षित करता है। अधिकांश विश्लेषण स्वचालित रूप से किया जाता है, हालांकि, उपयोगकर्ता से उन्नत न्यूक्लियोटाइड ज्ञान की अपेक्षा की जाती है, ज्यादातर परिणामों की व्याख्या के लिए। jmodeltest सफलतापूर्वक चलाने के लिए जावा रनटाइम पर्यावरण पर निर्भर करता है, लेकिन यह एकमात्र निर्भरता प्रदान करने की आवश्यकता है। यह एक पोर्टेबल पैकेज के अंदर लपेटा जाता है, इसलिए स्थापना की आवश्यकता नहीं है। Jmodeltest का इंटरफ़ेस काफी सरल है, लेकिन इसके अंदर एम्बेडेड फ़ंक्शंस एक और जटिल प्रकृति के हैं। अधिकांश जीयूआई डेटा के विश्लेषण और रिपोर्ट के लिए समर्पित है जो इस प्रक्रिया के परिणामस्वरूप, स्रोत फ़ाइल के अंदर निहित जानकारी के आधार पर काफी लंबा हो सकता है। पांच अलग-अलग चयन रणनीतियों हैं और ये विश्लेषण मेनू के अंदर एम्बेडेड हैं, निम्नानुसार हैं: एआईसी (अकैके सूचना मानदंड), बीआईसी (बेयसियन सूचना मानदंड), डीटी (निर्णय सिद्धांत), एचएलआरटी (पदानुक्रमित संभावना अनुपात परीक्षण) और फेलोजेनिक औसत। इन सभी को वास्तविक विश्लेषण प्रक्रिया से पहले कॉन्फ़िगर किया जा सकता है; उदाहरण के लिए, आप आत्मविश्वास अंतराल को समायोजित कर सकते हैं या मॉडल औसत करने के लिए एप्लिकेशन को सेट कर सकते हैं। इसे बंद करने के लिए, आप प्रोग्राम को एक संभावित स्कोर गणना करने के लिए निर्देश भी दे सकते हैं जो एक अनुकूलन दर भिन्नता और पूर्व-चयनित बेस पेड़ मॉडल पर निर्भर करता है। अंत में, jmodeltest समय और प्रयासों को बचा सकता है वैज्ञानिक पारंपरिक साधनों द्वारा डीएनए विश्लेषण संचालन करने में निवेश करेंगे। हालांकि, यह अनुशंसा की जाती है कि परिणामों को पूरी तरह से सत्यापित किया जाए। एंड्रीए मैटेरी द्वारा समीक्षा की गई, अंतिम बार 17 अगस्त, 2014 को अपडेट की गई

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