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एमजीएलटूल्स एक सॉफ्टवेयर है जो आणविक संरचनाओं के विज़ुअलाइजेशन और विश्लेषण के लिए स्क्रिप्प्स रिसर्च इंस्टीट्यूट के आणविक ग्राफिक्स प्रयोगशाला (एमजीएल) में विकसित किया गया है। इसके तीन मुख्य अनुप्रयोग हैं: - ऑटोडॉकटूल ऑटोडॉक की स्थापना और चलाने के लिए ग्राफिकल फ्रंट-एंड है - एक स्वचालित डॉकिंग सॉफ़्टवेयर यह अनुमान लगाने के लिए डिज़ाइन किया गया है कि कैसे छोटे अणु, जैसे कि सब्सट्रेट या दवा उम्मीदवार, ज्ञात 3 डी संरचना के रिसेप्टर से बंधे हैं। - पायथन आण्विक दर्शक - पीएमवी एक शक्तिशाली आणविक दर्शक है जिसमें कई अनुकूलन योग्य विशेषताएं हैं और आणविक सतहों को उन्नत वॉल्यूम प्रतिपादन तक प्रदर्शित करने से लेकर कई प्लग करने योग्य आदेशों के साथ आता है। - विजन एक दृश्य-प्रोग्रामिंग वातावरण है जिसमें कोई उपयोगकर्ता कम्प्यूटेशनल विधियों के उपन्यास संयोजन का वर्णन करने वाले नेटवर्क को इंटरैक्टिव रूप से बना सकता है, और वास्तव में कोड लिखने के बिना अपने डेटा के नए विज़ुअलाइज़ेशन प्रदान कर सकता है।

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