हेपेडिट जावा में स्थित हैप्लोटाइप असेंबली दर्शक
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हेपेडिट विवरण

HapEdit एक ऐसा उपकरण है जो उपयोगकर्ता को हैप्लोटाइप असेंबली की सटीकता का आकलन करने में मदद करने के लिए विशेष रूप से बनाया गया है। यह अगली पीढ़ी अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके किया जाता है। HapEdit एक उपकरण है जो जावा प्रोग्रामिंग भाषा की मदद से बनाया गया था और कई प्लेटफार्मों पर चलाया जा सकता है। मुख्य विशेषताएं: एक हैप्लोइड सर्वसम्मति अनुक्रम के बजाय, हैप्लोटाइप सेगमेंट हाप्लोटाइप असेंबली विंडो के शीर्ष पर प्रदर्शित होते हैं। एक गुणवत्ता स्कोर जो एकत्रित हैप्लोटाइप सेगमेंट के लिए सटीकता का आकलन करता है वह हैप्लोटाइप सेगमेंट के नीचे दिखाया गया है। एक पठन नाम रंगीन है, जो पढ़ने के लिए उपयोग की जाने वाली अनुक्रमण तकनीक को दर्शाता है। बेस-कॉल अलग-अलग रंगीन स्कोर के अनुसार अलग-अलग रंग होते हैं। यह कम गुणवत्ता वाले बेस-कॉल खोजने के लिए उपयोगकर्ता को सुविधाजनक बनाता है। असेंबली नेविगेशन विंडो में एक विशिष्ट क्षेत्र को डबल-क्लिक करके, उपयोगकर्ता उस क्षेत्र को विस्तृत दृश्य देख सकता है जो हैप्लोटाइप असेंबली विंडो में प्रदर्शित होता है। Misassembled haplotype खंड टुकड़ों में तोड़ दिया जा सकता है। पूरक डेटा द्वारा पुष्टि की गई हैप्लोटाइप सेगमेंट का कनेक्शन सरल माउस ऑपरेशंस द्वारा सक्षम है। अनुक्रमित प्रौद्योगिकियों की संरचना दरों का विश्लेषण किया जाता है और बार चार्ट में प्रदर्शित किया जाता है। इसी प्रकार, अनुक्रम और क्लोन कवरेज भी पाई चार्ट में संक्षेप में हैं।

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