हन-न्यू कंज़र्वेटिव और कट्टरपंथी नॉन्सिनमेंट्स डिस्टेंस की गणना के लिए एक विधि
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हन-न्यू रैंकिंग और सारांश

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अनुक्रम डीएनए अनुक्रम डीएनए आमूल-चूल विखंडन कट्टरपंथीय प्रभाव मौलिक दूरी एमिनो एसिड दूरी ट्रैकर नॉन्सिनमेंट्स की दर पितृती दूर निरर्थक दूरी एमिनो एसिड वर्गीकरण कट्टरपंथी नैनाम्य दूरी Nonsynymous प्रतिस्थापन कट्टरपंथी शिक्षार्थी दूरियाँ परिवर्तित करें मैपिंग दूरी

हन-न्यू विवरण

माननीय-नए आवेदन को प्रोटीन कोडिंग डीएनए अनुक्रमों के बीच रूढ़िवादी और कट्टरपंथी नॉन्सिनमेंट्स डिस्टेंस का अनुमान लगाने के लिए डिज़ाइन किया गया था। संक्रमण पूर्वाग्रह को ध्यान में रखते हुए यह विधि ह्यूजेस, ओटीए, और नीई (1990) की मूल विधि से संशोधित की जाती है। एमिनो एसिड वर्गीकरण के तीन प्रकार (चार्ज, ध्रुवीयता और मियाटा और यशुनागा) प्रदान किए जाते हैं। कोई भी रूढ़िवादी और कट्टरपंथी एमिनो एसिड को स्वयं से परिभाषित कर सकता है। कोई एमिनो एसिड समूहों को परिभाषित कर सकता है ताकि समूहों के बीच परिवर्तन कट्टरपंथी हैं और समूहों के भीतर रूढ़िवादी हैं। ऐसा करने के लिए, self.div नाम की एक फ़ाइल बनाएं। इस फ़ाइल में, पहली पंक्ति एमिनो एसिड के समूह होनी चाहिए (उदाहरण के लिए, चार्ज के मामले में, तीन समूह हैं ), दूसरी पंक्ति पहले समूह में एमिनो एसिड की संख्या है, एक स्थान, और समूह में एमिनो एसिड। एमिनो एसिड का एक-अक्षर कोड का उपयोग किया जाना चाहिए। अगली पंक्ति दूसरे समूह के लिए जानकारी होगी। यदि कुल एन समूह हैं, तो केवल पहले एन -1 समूहों की जानकारी इनपुट करने की आवश्यकता है, क्योंकि अंतिम समूह पहले एन -1 समूहों की जानकारी से प्राप्त किया जा सकता है।

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