लघु अनुक्रम स्थान मैपर एक बड़े अनुक्रम पर संक्षिप्त अनुक्रमों के स्थान का विश्लेषण और कल्पना करने के लिए लिखा गया एक कार्यक्रम
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लघु अनुक्रम स्थान मैपर रैंकिंग और सारांश

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अनुक्रम विश्लेषक विस्फोट अनुक्रम विश्लेषण

लघु अनुक्रम स्थान मैपर विवरण

लघु अनुक्रम स्थान मैपर अनुक्रम लोड करता है, फिर उन्हें संरेखित करता है और अंत में ग्राफ और तालिकाओं को एक ही समय में एक या अधिक डेटासेट के लिए उत्पन्न किया जा सकता है। एसएसएलएम आमतौर पर लघु सोलक्सा की एक विस्फोट डेटा आउटपुट फ़ाइल के साथ काम करता है जो आरएनए विषयों को मैप किए गए पढ़ता है (उदाहरण के लिए प्री-एमआईआरएनए अनुक्रम)। विश्लेषण डेटासेट में या विभिन्न प्रकार के आरएनए पर एक अनुक्रम पर किया जा सकता है। जेनरेट आउटपुट ऑन-स्क्रीन या टैब-अलग-अलग-, fasta-, टेक्स्ट- या टीआईएफएफ प्रारूप में है। एसएसएलएम शॉर्ट अनुक्रमों को उन बड़े अनुक्रम को जोड़ने के लिए विस्फोट खोज नहीं करेगा जो वे उत्पन्न होते हैं। एक परीक्षण ड्राइव के लिए संक्षिप्त अनुक्रम स्थान मैपर लें यह देखने के लिए कि यह सब क्या है!

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