मोलेकेल आपके मैक के लिए एक निःशुल्क और ओपन सोर्स आणविक विज़ुअलाइजेशन एप्लिकेशन
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कल्पना विजुअलाइज़र अणु को विज़ुअलाइज़ करें अणु अणु विजुअलाइज़र अणु दृश्यता

मोलेकेल विवरण

एक स्वतंत्र और खुला स्रोत अपने मैक के लिए आणविक दृश्य आवेदन Molekel एक खुला स्रोत है, उपयोग में आसान और मुक्त बहु मंच आणविक दृश्य कार्यक्रम के लिए। यहाँ "Molekel" के कुछ प्रमुख विशेषताएं हैं: · विभिन्न फ़ाइल स्वरूपों से आणविक डेटा पढ़ें · विभिन्न शैलियों के साथ प्रदर्शन अणुओं: Spacefill, गेंद और छड़ी, गेंद और वायर, स्टिक, रीढ़ (अवशेष), रिबन (अवशेष), योजनाबद्ध (अवशेष) · परमाणु और बांड का आकार बदलें · फ़ाइल से पढ़ें परमाणु रंग · प्रदर्शन द्विध्रुवीय संवेग (इस जानकारी को शामिल आणविक प्रारूपों के लिए) · चेतन प्रक्षेपवक्र और कंपन जानकारी कुछ फ़ाइल स्वरूपों में उपलब्ध का उपयोग कर परमाणुओं · चेतन अणुओं बहु फ्रेम pdb और xyz फ़ाइलों से पढ़ने · प्रदर्शन तीर की गति और प्रत्येक एनिमेटेड परमाणु की गति की दिशा दिखाने के लिए · चेतन आणविक सतहों (amimation निर्यात करते समय) · दूरी और (डिहेड्रल) कोण संगणना प्रदर्शन · अदिश क्षेत्र (जैसे इलेक्ट्रोस्टैटिक संभावित) कल्पना और 3 डी अंतरिक्ष में एक विशिष्ट बिंदु पर अदिश फ़ील्ड का मान प्रदर्शित करने के लिए एक समतल जांच का प्रयोग करें। · कल्पना आणविक कक्षीय इसो-सतहों वैकल्पिक इलेक्ट्रोस्टैटिक संभावित साथ रंग कोडित। इलेक्ट्रोस्टैटिक संभावित साथ कोडित रंग · कल्पना घनत्व मैट्रिक्स वैकल्पिक रूप से उत्पन्न जा रही है। · कल्पना ग्रिड डेटा से सतहों (गाऊसी घन स्वरूप में या एडीएफ tape41 फ़ाइलों से पढ़ने) वैकल्पिक रूप से रंग कोडित इलेक्ट्रोस्टैटिक संभावित साथ। · चिकना Laplacian समरेखण के साथ ग्रिड डेटा से उत्पन्न सतहों (गाऊसी .cube) · का प्रयोग करें ग्रिड डेटा आणविक विद्युत क्षमता के रूप में .cube फ़ाइलों से पढ़ने पर एसएएस और एसईएस सतहों मैप करने के लिए · आईएसओ सतह वैकल्पिक के रूप में कंप्यूट विलायक सुलभ भूतल इलेक्ट्रोस्टैटिक संभावित साथ रंग कोडित। · कंप्यूट और प्रदर्शन विलायक निकाले गए भूतल, वैकल्पिक रूप से एम.एफ. का उपयोग कर Sanner के एम.एस.एम. कार्यक्रम (अत्यधिक की सिफारिश की), उसे यहां से प्राप्त · अणु आणविक फ़ाइल स्वरूपों के एक नंबर करने के लिए निर्यात · (OpenBabel के माध्यम से प्रायोगिक,) पीओवी करने के लिए निर्यात · TIFF में निर्यात करें, PNG, पोस्टस्क्रिप्ट और पीडीएफ · निर्देशयोग्य shaders (GLSL) समर्थन · विकिरण स्पेक्ट्रा के दृश्य (इन्फ्रा-रेड और रमन) · उच्च गुणवत्ता विरोधी aliasing और बहुस्तरीय पारदर्शी सतहों के सही चित्रण के साथ प्रतिपादन बहु पारित · कम्पन प्रकार के सम्मिश्रण इस रिलीज में नया क्या है: · गहराई पारदर्शी वस्तुओं की सही चित्रण के लिए छीलने के लिए समर्थन जोड़ा; एक ओपन 2.0 कार्ड की आवश्यकता है और कुछ सिस्टम पर ठीक से काम नहीं हो सकता है। गहराई छीलने प्रतिपादन गति / पारदर्शी वस्तु की गुणवत्ता को प्रभावित मानकों प्रदर्शन-> देखें गुण संवाद के माध्यम से स्थापित किया जा सकता। · पोस्टस्क्रिप्ट और पीडीएफ उत्पादन के साथ अवरक्त और रमन स्पेक्ट्रा की साजिश जोड़ा गया · एकीकृत के साथ VTK 5.1 (सीवीएस संस्करण के बाद से वहाँ कोई आधिकारिक रिलीज अभी तक है) · विरोधी aliasing, डिफ़ॉल्ट रूप से अक्षम के लिए समर्थन जोड़ा; प्रदर्शन-> देखें गुण संवाद के माध्यम से सक्रिय किया जा सकता। · यह अब पारदर्शिता और कक्षीय सतहों के रंग बदलने के लिए संभव है। · इलेक्ट्रॉन घनत्व सतह संवाद में लगातार सेटिंग्स के लिए समर्थन जोड़ा गया। · नई एक्स-रे shaders जोड़ा कि VTK 5.1 के साथ ठीक से काम करते हैं। ठीक हो गया: · 392 - बहु अणु Gamess इनपुट के लिए जोड़ें समर्थन · 401 - कोनोली सतह हटाया नहीं जा सकता · 403 - कमांड लाइन का समर्थन · 404 - आणविक कक्षीय डेटा Molden पढ़ने में त्रुटि · 405 - दोनों कक्षीय रंग के लिए पारदर्शिता संगत नहीं (विशेष कार्ड / चालक पर निर्भर) · 406 - अणु को हटाने के बाद एनीमेशन रन · 408 - सुविधा का अनुरोध: शून्य से कक्षीय सूचकांक शुरू · 420 - सेटिंग्स जब विंडो बंद करने को सहेजा नहीं · 421 - ग्रिड डाटा से सतह: बीता हुआ समय रिपोर्ट गलत · 422 - पारदर्शी एसईएस के साथ एनिमेशन सहेजा नहीं जा सकता

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